養殖污水處理設備工業的選擇主要根據養殖污水性質而定，比較普遍存在的養殖場污水以有機物濃度高，懸浮物多，色度深，并含有大量的氨氮、有機磷含量高這些為常見原因。再根據水質特點，先去除懸浮物與色度，采用混凝沉淀工藝，有機物、氨氮、有機磷采用生化處理，因污染物濃度高，從成本及處理效果考慮，采用厭氧+好氧處理工藝。

養殖污水處理設備沉淀法是在重力作用下將重于水的懸浮物從水中分離出來的處理工藝，是廢水處理中應用廣的方法之一。目前，凡是有廢水處理設施的養殖場基本上都是在舍外串聯2至3個沉淀池，通過過濾、沉淀和氧化分解將糞水進行處理。篩網是篩濾所用的設施，廢水從篩網中的縫隙流過，而固體部分則憑機械或其本身的重量，截流下來，或推移到篩網的邊緣排出。養殖污水處理設備常用的畜禽糞便固液分離篩網有固定篩、振動篩和轉動篩。此外，還有常用的機械過濾設備如自動轉鼓過濾機、轉輥壓濾機、離心盤式分離機等。

養殖污水處理設備根據廢水的排放特點、水質特點及要求的排放要求，確定工藝分三個部分：首先是預處理，去除水中的懸浮物和浮油，降低后續處理的負荷并防止后續處理(尤其是生化處理)單元堵塞而影響處理效果，采用物化的方法；二是生化處理，這是整個養殖污水處理設備工藝的核心，通過微生物的新陳代謝作用，分解廢水中溶解性有機物；三是深度處理，采用物化方法，進一步除去水中的污染物，以保證出水達標排放。