串珠鐮刀菌探針法熒光定量PCR試劑盒
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串珠鐮刀菌探針法熒光定量RT-PCR試劑盒
Fusarium moniliforme
產品及特點:
熒光定量PCR是在PCR體系中加入熒光化合物(熒光染料或熒光探針)。利用熒光信號積累實時監測整個PCR進程,使每個循環變得“可見”。本產品就是以探針法熒光定量 RT-PCR 技術為基礎開發的專門檢測串珠鐮刀菌的試劑盒。
產品名稱 | 方法 | 規格 | 價格 |
串珠鐮刀菌LAMP試劑盒 | LAMP | 50次 | 2490元 |
串珠鐮刀菌PCR試劑盒 | PCR | 50次 | 1490元 |
串珠鐮刀菌染料法熒光定量PCR試劑盒 | 染料法 | 50次 | 2490元 |
串珠鐮刀菌探針法熒光定量PCR試劑盒 | 探針法 | 50次 | 3490元 |
它具有下列特點:
1. 即開即用,用戶只需要提供樣品RNA模板。
2. 引物和探針經過優化,靈敏性高。
3. 提供陽性對照,便于區分假陰性樣品。
4. 特異性高,引物是根據串珠鐮刀菌高度保守區設計,不會跟其他病毒的RNA發生交叉反應。
5. 本產品足夠 50 次 20μL 體系的探針法熒光定量 RT-PCR 反應。
6. 本產品只能用于科研。
規格及成分
成分 | 編號 | 十孔盒包裝 |
探針法 qRT-PCR 緩沖液 | A | 500μL(黃蓋) |
探針法 qRT-PCR 酶混合液 | B | 100μL(紅蓋) |
熒光 PCR 專用模板稀釋液 | C | 1 mL(黃蓋) |
串珠鐮刀菌探針法 qRT-PCR引物混合液 | D | 100 μL(白蓋) |
串珠鐮刀菌 qRT-PCR 探針 | E | 50 μL(棕色管) |
串珠鐮刀菌探針法 qRT-PCR陽性對照(1×10E8 拷貝/μL) | F | 50 μL(黃蓋) |
核酸釋釋劑(試用裝) | G | 20 次(1mL,綠蓋) |
使用手冊 | H | 一份 |
運輸及保存: 低溫運輸,-20℃保存,保存期限為12個月。
自備試劑 :樣品 RNA。
使用方法
一、稀釋標準曲線樣品(以 10E2-10E7 拷貝/μL 這 6 個 10 倍稀釋度為例)。由于標準品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分)。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原,本產品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的 DNA 片段作為陽性對照。
1. 標記 6 個離心管,分別為 7,6,5,4,3,2。
2. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 RT-PCR 專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同)。
3. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得 1×10E7 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
4. 換槍頭,在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩 1 分鐘,得 1×10E6 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
5. 換槍頭,在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得 1×10E5 拷貝/μL 的標準曲線樣品。放冰上待用。
6. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的標準曲線樣品。放冰上待用。
二、樣品 RNA 的制備
7. 如果有N個樣品,最好設置N+2個提取,多出的一個是PC(樣品制備陽性對照),一個是 NC(樣品制備陰性對照)。可以用10μL陽性對照的10000倍稀釋液再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣,以此作為PC。另外用水作為NC。
8. 用自選方法純化樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數病毒RNA提取試劑盒兼容。也以選購本公司的柱式病毒RNAout。本試劑盒免費贈送20次免RNA提取的核酸釋放劑試用裝,該釋放劑的裂解液可以直接作為RT-PCR模板,省略了RNA提取步驟。
三、Probe qRT-PCR 反應(20μL 體系,在樣品制備室進行)
9. 如果做定量分析并且只做1次重復,則標記N+9個PCR 管,其中N+2個用于上步得到的 N+2個樣品,1個用于PCR陰性對照(用水做模板),6個用于標準曲線。如果做定性分析,并且只做1次重復,則標記N+4 個PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1 個用于 PCR 陰性對照(用水做模板),1個用于PCR陽性對照(用第4號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。
10. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加):
成分 | 樣品管N+2個 | RT-PCR陰性對照管 | 標準曲線樣品管 (2-7 管) |
探針法qPCR緩沖液 | 各 10 μL | 10 μL | 各 10 μL |
探針法 qPCR 酶混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
串珠鐮刀菌qRT-PCR探針 | 各 1 μL | 1 μL | 各 1 μL |
串珠鐮刀菌探針qRT-PCR 引物混合液 | 各 2 μL | 2 μL | 各 2 μL |
待測樣品 RNA 模板 | 各 5 μL | -- | -- |
超純水 | -- | 5 μL | -- |
第 7 步所得標準曲線樣品稀釋液(2-7 號) | -- | -- | 各5 μL(2號樣到2號管,3號樣到3 號管…) |
11. 蓋上蓋子后上機,按下面參數進行 qRT-PCR:
過程 | 溫度 | 時間 |
逆轉錄 | 50℃ | 30 min |
預變性 | 94℃ | 10 min |
qRT-PCR 反應(40 個循環) | 94℃ | 15 sec |
60℃ | 1 min(采集 FAM 通道的熒光信號) |
五、數據處理
12. 如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸,以 Ct值為縱軸,繪制標準曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標準曲線上推算出樣品RNA 濃度的 log 值,再推算出其濃度。
13. 如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數增長,有典型擴增曲線,Ct 值應該小于或等于 30。對待測樣品,如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性,如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間,則重復一次。重復實驗的 Ct值如果大于或等于 40 則為陰性,如果小于 35,則為陽性。
六、常見問題與解決方法:
常見問題 | 可能原因 | 解決方法 |
陽性對照、待測樣本均無條帶。 | PCR反應體系或反應條件不合適。 | 使用梯度PCR摸索PCR反應條件。 |
PCR試劑保存不當失去活性。 | 2× PCR Mix應保存于-20℃,使用時避免反復凍融。若使用頻繁,可在4℃短時間存放。 | |
引物設計問題。 | 嘗試重新設計引物進行檢查。 | |
陽性對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱。 | 不當儲存或長期儲存引起試劑活性喪失。 | 使用新鮮的試劑。 |
加入組織裂解液過量。 | 增大反應體系,或減少裂解液的用量。 | |
樣本裂解混合液保存不當或保存時間過久,DNA基因組已經降解。 | 裂解混合液液可在4℃保存2-3天,盡量使用新制備的裂解液混合液進行PCR。 | |
模板加入量不適合。 | 在反應體系10-20%范圍內優化模板加入量。反應效性能較差時,可以降模板濃度調節到低于10%的范圍。 | |
PCR循環數不足。 | 適當增加PCR的循環數,推薦在35-40循環為佳。因為模板復雜,一般PCR反應要比用純化的 DNA模板多5-10個循環為佳。 | |
非特異性擴增 | PCR退火溫度太低,循環數、引物濃度或模板濃度太高。 | 增加PCR退火溫度,降低PCR循環數、引物濃度或模板濃度。 |
PCR引物錯配。 | 重新設計PCR引物。 | |
配制PCR反應體系時溫度太高或配制完成后放置時間太久。 | PCR反應體系的配制在低溫下進行,配制完成后盡快進行PCR擴增反應。 | |
陰性對照出現目的條帶 | 操作工具或試劑污染。 | 實驗所有試劑或器材均應高壓滅菌。操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內或濺出離心管外。 |
樣本間交叉污染。 | 每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。 |