游離氯可以氧化破壞反滲透膜，反滲透一般要求進水余氯<0.1ppm;有機物不僅是微生物的餌料，而且當其濃縮到一定程度后，可以溶解有機膜材料，使膜性能劣化。水中有機物種類繁多，不同的有機物對反滲透膜的危害也不一樣，因而在反滲透預處理系統設計時，如果水中總有機碳(TOC)的含量超過2mg/L，一般需要進行處理，對于以自來水為水源的凈化系統，活性炭吸附是必要的，因為地表水中有機物含量較高。一般認為，經過活性炭處理過的水中會含有大量微生物。但對于活性炭處理工藝,只要調整好反洗頻率及更換頻次,也可以防止微生物污染