EM菌（Effective Microorganisms）是由大約80種微生物組成，EM菌由日本琉球大學的比嘉照夫教授1982年研究成功，于80年代投入市場。EM菌是以光合細菌、乳酸菌、酵母菌和放線菌為主的10個屬 80余個微生物復合而成的一 種微生物菌制劑。作用機理是形成EM菌和病原微生物爭奪營養的競爭，由于em菌在土壤中極易生存繁殖，所以能較快而穩定地占據土壤中的生態地位，形成有益的微生物菌的優勢群落，從而控制病原微生物的繁殖和對作物的侵襲。是生態農業的發展方向，更有利于農業的可持續發展。