復混肥可以和有機肥配合使用，這樣對于肥效和利用率也是有幫助的，有機肥的施用不但可以改良土壤，節省資源，減輕環境污染，還能省掉很多繁瑣的傳統工序，為土壤提供大量的有益微生物來活化土壤的養分。有些復混專用肥還能根據作物的特點以及土壤的供肥特性來確定合適的配比，但是根據一些作物的實際生產情況還是需要添加一些有機肥的。