芐索氯銨，易溶于水形成泡沫狀肥皂水樣溶液，溶于乙醇、丙酮、氯仿。用于殺菌消毒劑，芐索氯銨是新型的防腐劑，具有較好的表面活性，廣泛用于日化，醫藥等領域做防腐、殺菌劑。芐索氯銨是一種新型的季銨鹽類抗菌劑，在日用化學品和化妝品行業有廣泛的應用。此外，作為殺菌抗菌劑在醫藥衛生領域也有重要的應用，比如作為滴眼液的抑菌組分或者作為注射液的抑菌成分在西方國家一直有廣泛的應用。在肝素鈉產品的生產中，芐索氯銨是必不可少的關鍵中間體。具有殺菌和祛臭的作用.結晶體極易溶于水和其它溶劑,能配制粉狀或液狀的家庭或工業殺菌劑消毒劑.還能作為防腐劑或抗菌劑用于局部施用的獸醫和專賣藥品,按照使用指南應用，對環境表面沒有腐蝕性。